Das Naturschutzgebiet Bergener Moos liegt im Landkreis Traunstein in Oberbayern westlich von Weißachen, einem Ortsteil der Gemeinde Bergen.
Am südlichen Rand fließt der Krummbach, nördlich fließt die Weiße Achen und verläuft die A 8. Nordwestlich erstreckt sich das 245,5 ha große Naturschutzgebiet Sossauer Filz und Wildmoos.