Das Naturschutzgebiet Schlappolt liegt auf dem Gebiet des Marktes Oberstdorf im Landkreis Oberallgäu im bayerischen Regierungsbezirk Schwaben. Am westlichen Rand des Gebietes mit dem 1940 Meter hohen Söllerkopf und dem 1968 Meter hohen Schlappoldkopf verläuft die Staatsgrenze zu Österreich.