Klášterský Mlýn je malá vesnice, část města Rejštejn v okrese Klatovy v Plzeňském kraji. Nachází se na levém břehu řeky Otavy asi 400 metrů severozápadně od Rejštejna. Je zde evidováno 16 adres. V roce 2021 zde trvale žilo 33 obyvatel.
Klášterský Mlýn leží v katastrálních územích Klášterský Mlýn I o rozloze 0,52 km² a Klášterský Mlýn II o rozloze 0,32 km².
Vesnice leží při soutoku řek Otava a Losenice, která přitéká od Rejštejna.